Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms