Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROTQ9UKG9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms