Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4Q9UBX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUX4Q9UBX2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms