Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 01e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 U2AF1-209ENST00000475639 4694 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 U2AF1-212ENST00000496462 3973 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.741e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 221.87■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 215.59■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)22.2■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.236e-10■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.816e-10■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.866e-10■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 ENAH-202ENST00000358675 3655 ntTSL 27.32□□□□□ -1.246e-10■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 ENAH-206ENST00000483952 578 ntTSL 43.49□□□□□ -1.856e-10■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 38.3
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-209ENST00000578904 1269 ntTSL 321.07■□□□□ 0.965e-16■■■■■ 38.2
DROSHAQ9NRR4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 38.1
DROSHAQ9NRR4 SNRPF-203ENST00000551316 787 ntTSL 223.05■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 38.1
DROSHAQ9NRR4 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 38.1
DROSHAQ9NRR4 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 38.1
DROSHAQ9NRR4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.371e-7■■■■■ 38.1
DROSHAQ9NRR4 AP000662.2-201ENST00000528466 567 ntTSL 426.73■■□□□ 1.871e-7■■■■■ 38.1
DROSHAQ9NRR4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.313e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 SLC38A10-210ENST00000573058 1627 nt38.19■■■■□ 3.73e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-230ENST00000577097 1014 ntTSL 328.45■■■□□ 2.143e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-225ENST00000576225 2316 ntTSL 226.75■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-216ENST00000574027 604 ntTSL 423.31■■□□□ 1.323e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 13e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-222ENST00000575841 509 ntTSL 219.17■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 MIR30C1-201ENST00000385227 89 ntBASIC12.79□□□□□ -0.367e-11■■■■■ 37.9
DROSHAQ9NRR4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.015e-6■■■■■ 37.8
DROSHAQ9NRR4 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.495e-6■■■■■ 37.8
DROSHAQ9NRR4 XYLT2-202ENST00000376550 3267 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.355e-6■■■■■ 37.8
DROSHAQ9NRR4 XYLT2-204ENST00000509778 145 ntTSL 316.06■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 37.8
DROSHAQ9NRR4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.172e-11■■■■■ 37.7
DROSHAQ9NRR4 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 37.6
DROSHAQ9NRR4 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 37.6
DROSHAQ9NRR4 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 37.6
DROSHAQ9NRR4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 37.6
DROSHAQ9NRR4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 37.6
DROSHAQ9NRR4 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 37.6
DROSHAQ9NRR4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 37.5
DROSHAQ9NRR4 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 37.4
DROSHAQ9NRR4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.531e-7■■■■■ 37.3
DROSHAQ9NRR4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.051e-7■■■■■ 37.3
DROSHAQ9NRR4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.291e-7■■■■■ 37.3
DROSHAQ9NRR4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.931e-6■■■■■ 37.3
DROSHAQ9NRR4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.751e-6■■■■■ 37.3
DROSHAQ9NRR4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.311e-6■■■■■ 37.3
DROSHAQ9NRR4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 37.3
DROSHAQ9NRR4 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 37.3
DROSHAQ9NRR4 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 37.3
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.322e-7■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 536.9■■■■□ 3.52e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 335.96■■■■□ 3.352e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 234.93■■■■□ 3.182e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 32e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.912e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.912e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 328.76■■■□□ 2.22e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.992e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.462e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 522.81■■□□□ 1.242e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.022e-10■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.839e-7■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 37.2
DROSHAQ9NRR4 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 332.28■■■□□ 2.763e-11■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.763e-11■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 229.1■■■□□ 2.253e-11■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 529.09■■■□□ 2.253e-11■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.323e-11■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 FAM114A1-203ENST00000510213 567 ntTSL 235.76■■■■□ 3.312e-9■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 FAM114A1-206ENST00000515037 1431 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 LSM4-202ENST00000593564 656 ntTSL 237.59■■■■□ 3.611e-6■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 LSM4-204ENST00000594828 807 ntTSL 236.2■■■■□ 3.391e-6■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.231e-6■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.381e-6■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 LSM4-206ENST00000600289 1113 ntTSL 224.97■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 RPP40-206ENST00000483546 654 ntTSL 323.99■■□□□ 1.434e-8■■■■■ 37.1
DROSHAQ9NRR4 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 341.12■■■■■ 4.178e-14■■■■■ 37
DROSHAQ9NRR4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.648e-14■■■■■ 37
DROSHAQ9NRR4 FAM117A-210ENST00000514018 1128 ntTSL 527.28■■□□□ 1.968e-14■■■■■ 37
DROSHAQ9NRR4 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 323.31■■□□□ 1.328e-14■■■■■ 37
DROSHAQ9NRR4 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.748e-14■■■■■ 37
DROSHAQ9NRR4 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 318.25■□□□□ 0.518e-14■■■■■ 37
DROSHAQ9NRR4 FAM117A-207ENST00000509347 572 ntTSL 415.24■□□□□ 0.038e-14■■■■■ 37
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