Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL40Q9NQ50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL40Q9NQ50 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms