Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD11Q96NU1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD11Q96NU1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms