Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
XIRP1Q702N8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
XIRP1Q702N8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
XIRP1Q702N8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
XIRP1Q702N8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms