Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms