Protein–RNA interactions for Protein: Q16678

CYP1B1, Cytochrome P450 1B1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1B1Q16678 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP1B1Q16678 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP1B1Q16678 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP1B1Q16678 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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