Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A2Q14055 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
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