Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
IRF5Q13568 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRF5Q13568 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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