Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.195e-7■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 522.41■■□□□ 1.185e-7■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.015e-7■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-7■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 IDH1-207ENST00000462386 1614 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 ATP5O-210ENST00000496044 673 ntTSL 220.64■□□□□ 0.892e-7■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 ATP5O-207ENST00000487374 469 ntTSL 519■□□□□ 0.632e-7■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 ATP5O-206ENST00000484627 157 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.972e-7■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 HNRNPM-205ENST00000596295 910 ntTSL 322.27■■□□□ 1.165e-8■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 ADH5-207ENST00000508146 722 ntTSL 413.87□□□□□ -0.192e-8■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 MIR4721-201ENST00000577590 89 ntBASIC14.03□□□□□ -0.161e-14■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 ZC3H18-205ENST00000564341 387 ntTSL 517.09■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 IMPDH2-205ENST00000463903 420 ntTSL 215.12■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 20.6
G3BP1Q13283 G6PD-204ENST00000433845 817 ntTSL 318.83■□□□□ 0.68e-7■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 G6PD-206ENST00000440967 1056 ntTSL 517.24■□□□□ 0.358e-7■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 EFTUD2-203ENST00000585616 575 ntTSL 414.95□□□□□ -0.022e-7■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 MSH6-211ENST00000606499 833 ntTSL 39.51□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 NOLC1-204ENST00000464969 2288 ntTSL 214.25□□□□□ -0.138e-8■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 NOLC1-207ENST00000488254 2441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.48e-8■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.718e-8■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.788e-8■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 NOLC1-208ENST00000603946 3217 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.798e-8■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 NOLC1-201ENST00000370007 3727 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.168e-8■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 APEH-212ENST00000469362 830 ntTSL 313.27□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 SRPRA-202ENST00000527817 687 ntTSL 215.1■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 CCT3-205ENST00000368261 863 ntTSL 513.48□□□□□ -0.251e-10■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 LDHA-209ENST00000478970 732 ntTSL 219.55■□□□□ 0.729e-16■■■■□ 20.5
G3BP1Q13283 MCM5-209ENST00000493076 4599 ntTSL 213.66□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 20.4
G3BP1Q13283 DKC1-202ENST00000412124 670 ntTSL 58.93□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 20.4
G3BP1Q13283 EIF4G1-231ENST00000464548 637 ntTSL 515.71■□□□□ 0.118e-9■■■■□ 20.4
G3BP1Q13283 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 20.4
G3BP1Q13283 PRPF19-205ENST00000540473 169 ntTSL 58.16□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 20.4
G3BP1Q13283 PKM-225ENST00000570166 626 ntTSL 28.59□□□□□ -1.031e-19■■■■□ 20.4
G3BP1Q13283 PPP6R1-204ENST00000587457 2389 ntTSL 218.75■□□□□ 0.598e-7■■■■□ 20.4
G3BP1Q13283 HSD17B4-213ENST00000509606 844 ntTSL 27.39□□□□□ -1.233e-7■■■■□ 20.4
G3BP1Q13283 PRMT5-219ENST00000555530 837 ntTSL 516.49■□□□□ 0.238e-7■■■■□ 20.4
G3BP1Q13283 CDK12-208ENST00000584336 1963 nt12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 CDK12-205ENST00000559663 871 ntTSL 59.97□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 COQ8A-207ENST00000485462 2141 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.613e-7■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 RPS25-204ENST00000527853 1462 ntTSL 222.41■■□□□ 1.182e-8■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-8■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 RPS25-203ENST00000527791 711 ntTSL 215.8■□□□□ 0.122e-8■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 RPS25-206ENST00000532567 508 ntTSL 26.89□□□□□ -1.312e-8■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 FTSJ3-205ENST00000580129 421 ntTSL 213.04□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 HNRNPM-216ENST00000602219 1809 nt17.68■□□□□ 0.421e-7■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 LDHA-221ENST00000543445 576 ntTSL 37.09□□□□□ -1.271e-15■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 GLDC-215ENST00000639493 553 ntTSL 312.9□□□□□ -0.342e-8■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 521.76■■□□□ 1.075e-11■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.515e-11■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.375e-11■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.215e-11■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 DAXX-207ENST00000468536 817 ntTSL 216.85■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 DAXX-208ENST00000477162 847 ntTSL 510.43□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 20.3
G3BP1Q13283 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 510.45□□□□□ -0.741e-8■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 CCT7-213ENST00000488856 612 ntTSL 210.32□□□□□ -0.764e-11■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 MCM5-202ENST00000382011 2402 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 MCM5-201ENST00000216122 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 NSFL1C-210ENST00000553571 752 ntTSL 412.25□□□□□ -0.453e-8■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)18.66■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 26.11□□□□□ -1.433e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 PLK1-203ENST00000562407 540 ntTSL 214.03□□□□□ -0.164e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 KDM5C-215ENST00000497995 394 ntTSL 39.12□□□□□ -0.952e-14■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 JUP-210ENST00000585793 598 ntTSL 217.83■□□□□ 0.443e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.938e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 BUD23-217ENST00000487006 631 ntTSL 326.65■■□□□ 1.861e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 VARS-221ENST00000463184 619 ntTSL 224.38■■□□□ 1.498e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.478e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 SORBS3-203ENST00000517535 3067 ntTSL 223.97■■□□□ 1.438e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 BUD23-202ENST00000421304 538 ntTSL 423.7■■□□□ 1.381e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 BUD23-208ENST00000432522 1074 ntTSL 223.33■■□□□ 1.331e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 BUD23-203ENST00000421744 895 ntTSL 223.3■■□□□ 1.321e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 BUD23-210ENST00000441822 632 ntTSL 323.19■■□□□ 1.31e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 BUD23-216ENST00000478670 572 ntTSL 423.18■■□□□ 1.31e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 BUD23-218ENST00000496153 505 ntTSL 423.18■■□□□ 1.31e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.268e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.248e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.168e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 NAB2-203ENST00000554718 791 ntTSL 521.71■■□□□ 1.078e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 KHK-204ENST00000464371 1042 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.858e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.848e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.728e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 SORBS3-211ENST00000521554 858 ntTSL 219.3■□□□□ 0.688e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 ANAPC7-211ENST00000552087 910 ntTSL 519.09■□□□□ 0.651e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.498e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.428e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 BUD23-205ENST00000428163 577 ntTSL 316.9■□□□□ 0.31e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 SORBS3-216ENST00000523348 680 ntTSL 216.1■□□□□ 0.178e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.178e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.148e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 ANAPC7-206ENST00000481473 1836 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.11e-10■■■■□ 20.2
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