Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRAP54198 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRAP54198 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRAP54198 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRAP54198 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRAP54198 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRAP54198 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRAP54198 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRAP54198 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRAP54198 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRAP54198 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRAP54198 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRAP54198 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRAP54198 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRAP54198 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRAP54198 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRAP54198 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRAP54198 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRAP54198 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRAP54198 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRAP54198 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRAP54198 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRAP54198 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRAP54198 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRAP54198 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRAP54198 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRAP54198 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRAP54198 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRAP54198 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRAP54198 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRAP54198 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRAP54198 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRAP54198 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRAP54198 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRAP54198 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRAP54198 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRAP54198 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRAP54198 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRAP54198 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRAP54198 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRAP54198 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRAP54198 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HIRAP54198 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HIRAP54198 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HIRAP54198 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRAP54198 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRAP54198 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRAP54198 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRAP54198 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRAP54198 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRAP54198 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRAP54198 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRAP54198 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRAP54198 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRAP54198 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRAP54198 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRAP54198 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRAP54198 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRAP54198 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRAP54198 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRAP54198 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRAP54198 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRAP54198 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRAP54198 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRAP54198 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRAP54198 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRAP54198 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRAP54198 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRAP54198 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
HIRAP54198 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRAP54198 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRAP54198 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRAP54198 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRAP54198 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRAP54198 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRAP54198 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRAP54198 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRAP54198 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms