Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCSHP14314 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms