Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN5O00501 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN5O00501 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms