Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPDC1A2A3K4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms