Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms