Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 UNC93B1-207ENST00000531152 729 ntTSL 328.97■■■□□ 2.232e-7■□□□□ 9.3
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PRPF4O43172 UNC93B1-210ENST00000622364 1021 ntTSL 221.27■■□□□ 12e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 UNC93B1-208ENST00000533424 1275 ntTSL 520.91■□□□□ 0.942e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 UNC93B1-206ENST00000530138 821 ntTSL 218.43■□□□□ 0.542e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 UNC93B1-202ENST00000524455 836 ntTSL 516.72■□□□□ 0.272e-7■□□□□ 9.3
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PRPF4O43172 CTSH-214ENST00000534038 593 ntTSL 417.9■□□□□ 0.461e-13■□□□□ 9.3
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PRPF4O43172 CTSH-205ENST00000528191 569 ntTSL 48.82□□□□□ -11e-13■□□□□ 9.3
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PRPF4O43172 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.782e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.671e-8■□□□□ 9.3
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PRPF4O43172 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-6■□□□□ 9.3
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PRPF4O43172 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 02e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-8■□□□□ 9.3
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PRPF4O43172 TBC1D24-208ENST00000630263 4180 ntTSL 514.65□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 9.3
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PRPF4O43172 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TTC7A-208ENST00000474321 622 ntTSL 513.67□□□□□ -0.222e-8■□□□□ 9.3
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PRPF4O43172 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 F2-204ENST00000490274 545 ntTSL 313.23□□□□□ -0.293e-13■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SSR1-208ENST00000483409 570 ntTSL 412.72□□□□□ -0.373e-10■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 FOXK2-208ENST00000571160 496 ntTSL 512.62□□□□□ -0.392e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TTC7A-211ENST00000491786 3615 ntTSL 1 (best)12.05□□□□□ -0.482e-8■□□□□ 9.3
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