RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.59■■■■■ 4.25
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CBX1-201ENST00000225603 ABCC9O60706 1549 aa34.79■■■■□ 3.16
CBX1-201ENST00000225603 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.54■■■■□ 3.12
CBX1-201ENST00000225603 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.34■■■■□ 3.09
CBX1-201ENST00000225603 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.04■■■■□ 3.04
CBX1-201ENST00000225603 NACADO15069 1562 aa33.96■■■■□ 3.03
CBX1-201ENST00000225603 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.78■■■■□ 3
CBX1-201ENST00000225603 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.74■■■□□ 2.99
CBX1-201ENST00000225603 SCRIBQ14160 1630 aa33.46■■■□□ 2.95
CBX1-201ENST00000225603 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.07■■■□□ 2.89
CBX1-201ENST00000225603 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.81■■■□□ 2.84
CBX1-201ENST00000225603 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.84
CBX1-201ENST00000225603 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.41■■■□□ 2.78
CBX1-201ENST00000225603 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CBX1-201ENST00000225603 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CBX1-201ENST00000225603 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.16■■■□□ 2.74
CBX1-201ENST00000225603 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CBX1-201ENST00000225603 SMARCA4P51532 1647 aa32.03■■■□□ 2.72
CBX1-201ENST00000225603 WIZO95785 1651 aa31.85■■■□□ 2.69
CBX1-201ENST00000225603 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
CBX1-201ENST00000225603 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.63■■■□□ 2.65
CBX1-201ENST00000225603 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.62■■■□□ 2.65
CBX1-201ENST00000225603 SMARCA2P51531 1590 aa31.53■■■□□ 2.64
CBX1-201ENST00000225603 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CBX1-201ENST00000225603 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.44■■■□□ 2.62
CBX1-201ENST00000225603 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
CBX1-201ENST00000225603 NCAPD3P42695 1498 aa31.39■■■□□ 2.62
CBX1-201ENST00000225603 HMGXB3Q12766 1538 aa31.28■■■□□ 2.6
CBX1-201ENST00000225603 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.21■■■□□ 2.59
CBX1-201ENST00000225603 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.09■■■□□ 2.57
CBX1-201ENST00000225603 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.75■■■□□ 2.51
CBX1-201ENST00000225603 CFTRP13569 1480 aa30.6■■■□□ 2.49
CBX1-201ENST00000225603 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.57■■■□□ 2.49
CBX1-201ENST00000225603 NESP48681 1621 aa30.46■■■□□ 2.47
CBX1-201ENST00000225603 ABCC8Q09428 1581 aa30.45■■■□□ 2.46
CBX1-201ENST00000225603 TRIM41Q8WV44 630 aa30.37■■■□□ 2.45
CBX1-201ENST00000225603 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.33■■■□□ 2.45
CBX1-201ENST00000225603 PRDM2Q13029 1718 aa30.32■■■□□ 2.44
CBX1-201ENST00000225603 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.26■■■□□ 2.43
CBX1-201ENST00000225603 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.23■■■□□ 2.43
CBX1-201ENST00000225603 SYNJ1O43426 1573 aa30.16■■■□□ 2.42
CBX1-201ENST00000225603 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.13■■■□□ 2.41
CBX1-201ENST00000225603 CUX1P39880 1505 aa30.08■■■□□ 2.41
CBX1-201ENST00000225603 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.05■■■□□ 2.4
CBX1-201ENST00000225603 TOP2BQ02880 1626 aa30.03■■■□□ 2.4
CBX1-201ENST00000225603 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.02■■■□□ 2.4
CBX1-201ENST00000225603 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.98■■■□□ 2.39
CBX1-201ENST00000225603 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CBX1-201ENST00000225603 TOPBP1Q92547 1522 aa29.87■■■□□ 2.37
CBX1-201ENST00000225603 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
CBX1-201ENST00000225603 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.86■■■□□ 2.37
CBX1-201ENST00000225603 SOGA1O94964 1423 aa29.83■■■□□ 2.37
CBX1-201ENST00000225603 ERCC6Q03468 1493 aa29.82■■■□□ 2.36
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CBX1-201ENST00000225603 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.65■■■□□ 2.34
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CBX1-201ENST00000225603 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.61■■■□□ 2.33
CBX1-201ENST00000225603 EEA1Q15075 1411 aa29.58■■■□□ 2.33
CBX1-201ENST00000225603 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.55■■■□□ 2.32
CBX1-201ENST00000225603 CUX2O14529 1486 aa29.54■■■□□ 2.32
CBX1-201ENST00000225603 KIF27Q86VH2 1401 aa29.51■■■□□ 2.31
CBX1-201ENST00000225603 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.5■■■□□ 2.31
CBX1-201ENST00000225603 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.49■■■□□ 2.31
CBX1-201ENST00000225603 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CBX1-201ENST00000225603 WDR97A6NE52 1622 aa29.41■■■□□ 2.3
CBX1-201ENST00000225603 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CBX1-201ENST00000225603 IFT140Q96RY7 1462 aa29.35■■■□□ 2.29
CBX1-201ENST00000225603 IGF1RP08069 1367 aa29.34■■■□□ 2.29
CBX1-201ENST00000225603 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.28■■■□□ 2.28
CBX1-201ENST00000225603 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CBX1-201ENST00000225603 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.26■■■□□ 2.27
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CBX1-201ENST00000225603 KIF21BO75037 1637 aa29.23■■■□□ 2.27
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CBX1-201ENST00000225603 GOLGA3Q08378 1498 aa29.2■■■□□ 2.26
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CBX1-201ENST00000225603 PBRM1Q86U86 1689 aa29.07■■■□□ 2.24
CBX1-201ENST00000225603 GRIN2BQ13224 1484 aa29.07■■■□□ 2.24
CBX1-201ENST00000225603 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.06■■■□□ 2.24
CBX1-201ENST00000225603 CUL7Q14999 1698 aa29.03■■■□□ 2.24
CBX1-201ENST00000225603 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.94■■■□□ 2.22
CBX1-201ENST00000225603 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.93■■■□□ 2.22
CBX1-201ENST00000225603 ADAMTS12P58397 1594 aa28.92■■■□□ 2.22
CBX1-201ENST00000225603 CEP162Q5TB80 1403 aa28.89■■■□□ 2.22
CBX1-201ENST00000225603 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CBX1-201ENST00000225603 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CBX1-201ENST00000225603 SYNJ2O15056 1496 aa28.75■■■□□ 2.19
CBX1-201ENST00000225603 CLIP1P30622 1438 aa28.75■■■□□ 2.19
CBX1-201ENST00000225603 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
CBX1-201ENST00000225603 GRIN2AQ12879 1464 aa28.72■■■□□ 2.19
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