RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592113.5

PTBP1-217, Transcript of polypyrimidine tract binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene PTBP1, Length 1,548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1-217ENST00000592113 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.91■■■■■ 6.06
PTBP1-217ENST00000592113 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.79■■■■■ 5.08
PTBP1-217ENST00000592113 ABCC9O60706 1549 aa44.72■■■■■ 4.75
PTBP1-217ENST00000592113 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
PTBP1-217ENST00000592113 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.86■■■■■ 4.61
PTBP1-217ENST00000592113 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.79■■■■■ 4.6
PTBP1-217ENST00000592113 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.69■■■■■ 4.59
PTBP1-217ENST00000592113 NACADO15069 1562 aa43.68■■■■■ 4.58
PTBP1-217ENST00000592113 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.54■■■■■ 4.56
PTBP1-217ENST00000592113 SCRIBQ14160 1630 aa42.71■■■■■ 4.43
PTBP1-217ENST00000592113 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.59■■■■■ 4.41
PTBP1-217ENST00000592113 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.34■■■■■ 4.37
PTBP1-217ENST00000592113 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.07■■■■■ 4.33
PTBP1-217ENST00000592113 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.29
PTBP1-217ENST00000592113 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.04■■■■■ 4.16
PTBP1-217ENST00000592113 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
PTBP1-217ENST00000592113 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
PTBP1-217ENST00000592113 SMARCA4P51532 1647 aa40.93■■■■■ 4.14
PTBP1-217ENST00000592113 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.77■■■■■ 4.12
PTBP1-217ENST00000592113 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
PTBP1-217ENST00000592113 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.55■■■■■ 4.08
PTBP1-217ENST00000592113 SMARCA2P51531 1590 aa40.49■■■■■ 4.07
PTBP1-217ENST00000592113 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.49■■■■■ 4.07
PTBP1-217ENST00000592113 WIZO95785 1651 aa40.44■■■■■ 4.06
PTBP1-217ENST00000592113 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.37■■■■■ 4.05
PTBP1-217ENST00000592113 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
PTBP1-217ENST00000592113 HMGXB3Q12766 1538 aa40.2■■■■■ 4.03
PTBP1-217ENST00000592113 NCAPD3P42695 1498 aa40.2■■■■■ 4.03
PTBP1-217ENST00000592113 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
PTBP1-217ENST00000592113 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
PTBP1-217ENST00000592113 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.98■■■■□ 3.99
PTBP1-217ENST00000592113 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.52■■■■□ 3.92
PTBP1-217ENST00000592113 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.11■■■■□ 3.85
PTBP1-217ENST00000592113 PRDM2Q13029 1718 aa39.09■■■■□ 3.85
PTBP1-217ENST00000592113 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.08■■■■□ 3.85
PTBP1-217ENST00000592113 CFTRP13569 1480 aa39.07■■■■□ 3.84
PTBP1-217ENST00000592113 NESP48681 1621 aa38.95■■■■□ 3.83
PTBP1-217ENST00000592113 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.76■■■■□ 3.8
PTBP1-217ENST00000592113 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.69■■■■□ 3.78
PTBP1-217ENST00000592113 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.66■■■■□ 3.78
PTBP1-217ENST00000592113 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.6■■■■□ 3.77
PTBP1-217ENST00000592113 ERCC6Q03468 1493 aa38.57■■■■□ 3.77
PTBP1-217ENST00000592113 ABCC8Q09428 1581 aa38.43■■■■□ 3.74
PTBP1-217ENST00000592113 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.35■■■■□ 3.73
PTBP1-217ENST00000592113 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.32■■■■□ 3.73
PTBP1-217ENST00000592113 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.27■■■■□ 3.72
PTBP1-217ENST00000592113 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
PTBP1-217ENST00000592113 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.22■■■■□ 3.71
PTBP1-217ENST00000592113 CUX1P39880 1505 aa38.21■■■■□ 3.71
PTBP1-217ENST00000592113 SYNJ1O43426 1573 aa38.21■■■■□ 3.71
PTBP1-217ENST00000592113 TOP2BQ02880 1626 aa38.2■■■■□ 3.71
PTBP1-217ENST00000592113 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
PTBP1-217ENST00000592113 WDR62O43379 1518 aa38.17■■■■□ 3.7
PTBP1-217ENST00000592113 TOPBP1Q92547 1522 aa38.17■■■■□ 3.7
PTBP1-217ENST00000592113 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.1■■■■□ 3.69
PTBP1-217ENST00000592113 TRIM41Q8WV44 630 aa38.06■■■■□ 3.68
PTBP1-217ENST00000592113 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.97■■■■□ 3.67
PTBP1-217ENST00000592113 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
PTBP1-217ENST00000592113 CUX2O14529 1486 aa37.78■■■■□ 3.64
PTBP1-217ENST00000592113 SOGA1O94964 1423 aa37.74■■■■□ 3.63
PTBP1-217ENST00000592113 IFT140Q96RY7 1462 aa37.72■■■■□ 3.63
PTBP1-217ENST00000592113 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
PTBP1-217ENST00000592113 WDR97A6NE52 1622 aa37.69■■■■□ 3.62
PTBP1-217ENST00000592113 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.68■■■■□ 3.62
PTBP1-217ENST00000592113 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.63■■■■□ 3.62
PTBP1-217ENST00000592113 KIF27Q86VH2 1401 aa37.49■■■■□ 3.59
PTBP1-217ENST00000592113 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.46■■■■□ 3.59
PTBP1-217ENST00000592113 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
PTBP1-217ENST00000592113 EEA1Q15075 1411 aa37.43■■■■□ 3.58
PTBP1-217ENST00000592113 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
PTBP1-217ENST00000592113 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
PTBP1-217ENST00000592113 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.36■■■■□ 3.57
PTBP1-217ENST00000592113 PBRM1Q86U86 1689 aa37.36■■■■□ 3.57
PTBP1-217ENST00000592113 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.31■■■■□ 3.56
PTBP1-217ENST00000592113 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.3■■■■□ 3.567e-16■■■■■ 35.5
PTBP1-217ENST00000592113 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.24■■■■□ 3.55
PTBP1-217ENST00000592113 GRIN2BQ13224 1484 aa37.23■■■■□ 3.55
PTBP1-217ENST00000592113 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
PTBP1-217ENST00000592113 CUL7Q14999 1698 aa37.18■■■■□ 3.54
PTBP1-217ENST00000592113 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.11■■■■□ 3.53
PTBP1-217ENST00000592113 IGF1RP08069 1367 aa37.08■■■■□ 3.53
PTBP1-217ENST00000592113 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
PTBP1-217ENST00000592113 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.06■■■■□ 3.52
PTBP1-217ENST00000592113 ADAMTS12P58397 1594 aa37.04■■■■□ 3.52
PTBP1-217ENST00000592113 KIF21BO75037 1637 aa36.99■■■■□ 3.51
PTBP1-217ENST00000592113 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.95■■■■□ 3.51
PTBP1-217ENST00000592113 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.95■■■■□ 3.51
PTBP1-217ENST00000592113 PRXQ9BXM0 1461 aa36.94■■■■□ 3.5
PTBP1-217ENST00000592113 SYNJ2O15056 1496 aa36.89■■■■□ 3.5
PTBP1-217ENST00000592113 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.89■■■■□ 3.5
PTBP1-217ENST00000592113 GOLGA3Q08378 1498 aa36.83■■■■□ 3.49
PTBP1-217ENST00000592113 CHD1O14646 1710 aa36.81■■■■□ 3.48
PTBP1-217ENST00000592113 GRIN2AQ12879 1464 aa36.76■■■■□ 3.48
PTBP1-217ENST00000592113 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
PTBP1-217ENST00000592113 FBLN2P98095 1184 aa36.72■■■■□ 3.47
PTBP1-217ENST00000592113 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.66■■■■□ 3.46
PTBP1-217ENST00000592113 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.65■■■■□ 3.46
PTBP1-217ENST00000592113 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
PTBP1-217ENST00000592113 CEP170Q5SW79 1584 aa36.54■■■■□ 3.44
PTBP1-217ENST00000592113 NUP160Q12769 1436 aa36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms