Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
A4D1N5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
A4D1N5 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms