Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG3P56975 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG3P56975 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG3P56975 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG3P56975 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRG3P56975 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms