Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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