RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577700.5

SNHG15-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 15, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG15, Length 3,116 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG15-202ENST00000577700 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.7■■■□□ 2.19
SNHG15-202ENST00000577700 HRCP23327 699 aa27■■□□□ 1.91
SNHG15-202ENST00000577700 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SNHG15-202ENST00000577700 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SNHG15-202ENST00000577700 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.25■■□□□ 1.79
SNHG15-202ENST00000577700 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.93■■□□□ 1.74
SNHG15-202ENST00000577700 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
SNHG15-202ENST00000577700 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.83■■□□□ 1.72
SNHG15-202ENST00000577700 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SNHG15-202ENST00000577700 MYT1Q01538 1121 aa25.66■■□□□ 1.7
SNHG15-202ENST00000577700 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.61■■□□□ 1.69
SNHG15-202ENST00000577700 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.43■■□□□ 1.66
SNHG15-202ENST00000577700 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SNHG15-202ENST00000577700 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.21■■□□□ 1.63
SNHG15-202ENST00000577700 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNHG15-202ENST00000577700 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.1■■□□□ 1.61
SNHG15-202ENST00000577700 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SNHG15-202ENST00000577700 NEUROD1Q13562 356 aa24.94■■□□□ 1.58
SNHG15-202ENST00000577700 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.84■■□□□ 1.57
SNHG15-202ENST00000577700 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SNHG15-202ENST00000577700 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SNHG15-202ENST00000577700 ABCC9O60706 1549 aa24.49■■□□□ 1.51
SNHG15-202ENST00000577700 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.37■■□□□ 1.49
SNHG15-202ENST00000577700 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SNHG15-202ENST00000577700 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SNHG15-202ENST00000577700 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SNHG15-202ENST00000577700 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SNHG15-202ENST00000577700 BCL11AQ9H165 835 aa24.04■■□□□ 1.44
SNHG15-202ENST00000577700 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SNHG15-202ENST00000577700 TRIM41Q8WV44 630 aa23.96■■□□□ 1.43
SNHG15-202ENST00000577700 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SNHG15-202ENST00000577700 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.89■■□□□ 1.41
SNHG15-202ENST00000577700 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.79■■□□□ 1.4
SNHG15-202ENST00000577700 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SNHG15-202ENST00000577700 MIER1Q8N108 512 aa23.72■■□□□ 1.39
SNHG15-202ENST00000577700 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.57■■□□□ 1.36
SNHG15-202ENST00000577700 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.56■■□□□ 1.36
SNHG15-202ENST00000577700 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SNHG15-202ENST00000577700 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.41■■□□□ 1.34
SNHG15-202ENST00000577700 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SNHG15-202ENST00000577700 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.3■■□□□ 1.32
SNHG15-202ENST00000577700 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SNHG15-202ENST00000577700 NACADO15069 1562 aa23.21■■□□□ 1.31
SNHG15-202ENST00000577700 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
SNHG15-202ENST00000577700 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
SNHG15-202ENST00000577700 BCANQ96GW7 911 aa22.99■■□□□ 1.27
SNHG15-202ENST00000577700 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SNHG15-202ENST00000577700 CEP162Q5TB80 1403 aa22.95■■□□□ 1.27
SNHG15-202ENST00000577700 SCRIBQ14160 1630 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG15-202ENST00000577700 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SNHG15-202ENST00000577700 FKBP8Q14318 412 aa22.83■■□□□ 1.24
SNHG15-202ENST00000577700 MSH5O43196 834 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG15-202ENST00000577700 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG15-202ENST00000577700 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.74■■□□□ 1.23
SNHG15-202ENST00000577700 KCNH8Q96L42 1107 aa22.73■■□□□ 1.23
SNHG15-202ENST00000577700 ITGAEP38570 1179 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG15-202ENST00000577700 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SNHG15-202ENST00000577700 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.58■■□□□ 1.2
SNHG15-202ENST00000577700 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.58■■□□□ 1.2
SNHG15-202ENST00000577700 ABCC8Q09428 1581 aa22.58■■□□□ 1.2
SNHG15-202ENST00000577700 NEFLP07196 543 aa22.57■■□□□ 1.2
SNHG15-202ENST00000577700 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SNHG15-202ENST00000577700 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.54■■□□□ 1.2
SNHG15-202ENST00000577700 SOGA1O94964 1423 aa22.54■■□□□ 1.2
SNHG15-202ENST00000577700 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SNHG15-202ENST00000577700 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SNHG15-202ENST00000577700 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SNHG15-202ENST00000577700 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG15-202ENST00000577700 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG15-202ENST00000577700 APLP2Q06481 763 aa22.48■■□□□ 1.19
SNHG15-202ENST00000577700 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.48■■□□□ 1.19
SNHG15-202ENST00000577700 WIZO95785 1651 aa22.47■■□□□ 1.19
SNHG15-202ENST00000577700 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG15-202ENST00000577700 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.39■■□□□ 1.18
SNHG15-202ENST00000577700 GOLGA3Q08378 1498 aa22.38■■□□□ 1.17
SNHG15-202ENST00000577700 EEA1Q15075 1411 aa22.34■■□□□ 1.17
SNHG15-202ENST00000577700 TRIM52Q96A61 297 aa22.33■■□□□ 1.17
SNHG15-202ENST00000577700 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SNHG15-202ENST00000577700 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SNHG15-202ENST00000577700 CLIP1P30622 1438 aa22.28■■□□□ 1.16
SNHG15-202ENST00000577700 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SNHG15-202ENST00000577700 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.27■■□□□ 1.16
SNHG15-202ENST00000577700 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.26■■□□□ 1.15
SNHG15-202ENST00000577700 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SNHG15-202ENST00000577700 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG15-202ENST00000577700 NBR1Q14596 966 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG15-202ENST00000577700 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SNHG15-202ENST00000577700 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG15-202ENST00000577700 CCER2I3L3R5 266 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG15-202ENST00000577700 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SNHG15-202ENST00000577700 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.1■■□□□ 1.13
SNHG15-202ENST00000577700 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG15-202ENST00000577700 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SNHG15-202ENST00000577700 ANP32CO43423 234 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG15-202ENST00000577700 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SNHG15-202ENST00000577700 KIF21BO75037 1637 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG15-202ENST00000577700 IL27Q8NEV9 243 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG15-202ENST00000577700 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG15-202ENST00000577700 WDR97A6NE52 1622 aa21.97■■□□□ 1.11
SNHG15-202ENST00000577700 CUX2O14529 1486 aa21.97■■□□□ 1.11
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