Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms