Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP350Q5VT06 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP350Q5VT06 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP350Q5VT06 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP350Q5VT06 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms