RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409559.7

CNRIP1-202, Transcript of cannabinoid receptor interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNRIP1, Length 644 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1-202ENST00000409559 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.01■■■■□ 3.04
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CNRIP1-202ENST00000409559 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.21■■■□□ 2.27
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CNRIP1-202ENST00000409559 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.84■■■□□ 2.21
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CNRIP1-202ENST00000409559 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.77■■■□□ 2.04
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CNRIP1-202ENST00000409559 SMARCA4P51532 1647 aa26.53■■□□□ 1.84
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CNRIP1-202ENST00000409559 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.96■■□□□ 1.75
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CNRIP1-202ENST00000409559 WDR62O43379 1518 aa25.74■■□□□ 1.71
CNRIP1-202ENST00000409559 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.67■■□□□ 1.7
CNRIP1-202ENST00000409559 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.64■■□□□ 1.69
CNRIP1-202ENST00000409559 CFTRP13569 1480 aa25.63■■□□□ 1.69
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CNRIP1-202ENST00000409559 TRIM41Q8WV44 630 aa25.58■■□□□ 1.69
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CNRIP1-202ENST00000409559 TOPBP1Q92547 1522 aa25.12■■□□□ 1.61
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CNRIP1-202ENST00000409559 ARHGEF11O15085 1522 aa24.94■■□□□ 1.58
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CNRIP1-202ENST00000409559 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CNRIP1-202ENST00000409559 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CNRIP1-202ENST00000409559 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.85■■□□□ 1.57
CNRIP1-202ENST00000409559 FBLN2P98095 1184 aa24.82■■□□□ 1.56
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CNRIP1-202ENST00000409559 CHD1O14646 1710 aa24.77■■□□□ 1.56
CNRIP1-202ENST00000409559 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.77■■□□□ 1.56
CNRIP1-202ENST00000409559 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CNRIP1-202ENST00000409559 ARAP1Q96P48 1450 aa24.68■■□□□ 1.54
CNRIP1-202ENST00000409559 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.66■■□□□ 1.54
CNRIP1-202ENST00000409559 WDR97A6NE52 1622 aa24.65■■□□□ 1.54
CNRIP1-202ENST00000409559 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
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CNRIP1-202ENST00000409559 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.62■■□□□ 1.53
CNRIP1-202ENST00000409559 CUX1P39880 1505 aa24.6■■□□□ 1.53
CNRIP1-202ENST00000409559 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CNRIP1-202ENST00000409559 GRIN2BQ13224 1484 aa24.58■■□□□ 1.52
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CNRIP1-202ENST00000409559 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CNRIP1-202ENST00000409559 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.32■■□□□ 1.48
CNRIP1-202ENST00000409559 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
CNRIP1-202ENST00000409559 GRIN2AQ12879 1464 aa24.23■■□□□ 1.47
CNRIP1-202ENST00000409559 NUP160Q12769 1436 aa24.18■■□□□ 1.46
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CNRIP1-202ENST00000409559 ADAMTS12P58397 1594 aa24.14■■□□□ 1.45
CNRIP1-202ENST00000409559 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.13■■□□□ 1.45
CNRIP1-202ENST00000409559 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CNRIP1-202ENST00000409559 CEP170Q5SW79 1584 aa24.12■■□□□ 1.45
CNRIP1-202ENST00000409559 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.12■■□□□ 1.45
CNRIP1-202ENST00000409559 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.09■■□□□ 1.45
CNRIP1-202ENST00000409559 SHROOM2Q13796 1616 aa24.04■■□□□ 1.44
CNRIP1-202ENST00000409559 JPH4Q96JJ6 628 aa24■■□□□ 1.43
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