Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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