Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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