Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms