Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms