Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CTF1Q16619 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CTF1Q16619 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CTF1Q16619 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTF1Q16619 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTF1Q16619 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTF1Q16619 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTF1Q16619 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTF1Q16619 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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