Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms