Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms