Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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