Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms