Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND3Q9UK17 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND3Q9UK17 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms