Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD1Q9UIS9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD1Q9UIS9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms