Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MBD2Q9UBB5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms