Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL9Q9P2J3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL9Q9P2J3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms