Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF3Q9NR81 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms