Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NLRP1Q9C000 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP1Q9C000 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NLRP1Q9C000 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms