Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMP19Q99542 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP19Q99542 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP19Q99542 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms