Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
MMP19Q99542 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
MMP19Q99542 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
MMP19Q99542 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
MMP19Q99542 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
MMP19Q99542 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
MMP19Q99542 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
MMP19Q99542 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38■■■■□ 3.67
MMP19Q99542 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MMP19Q99542 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MMP19Q99542 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
MMP19Q99542 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MMP19Q99542 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MMP19Q99542 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MMP19Q99542 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MMP19Q99542 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
MMP19Q99542 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
MMP19Q99542 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
MMP19Q99542 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
MMP19Q99542 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MMP19Q99542 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MMP19Q99542 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MMP19Q99542 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MMP19Q99542 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MMP19Q99542 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MMP19Q99542 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MMP19Q99542 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MMP19Q99542 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MMP19Q99542 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
MMP19Q99542 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MMP19Q99542 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MMP19Q99542 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
MMP19Q99542 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MMP19Q99542 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MMP19Q99542 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
MMP19Q99542 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
MMP19Q99542 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
MMP19Q99542 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MMP19Q99542 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MMP19Q99542 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MMP19Q99542 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MMP19Q99542 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MMP19Q99542 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MMP19Q99542 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MMP19Q99542 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MMP19Q99542 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MMP19Q99542 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
MMP19Q99542 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MMP19Q99542 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MMP19Q99542 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MMP19Q99542 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
MMP19Q99542 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MMP19Q99542 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MMP19Q99542 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MMP19Q99542 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MMP19Q99542 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MMP19Q99542 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MMP19Q99542 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MMP19Q99542 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MMP19Q99542 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MMP19Q99542 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MMP19Q99542 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
MMP19Q99542 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MMP19Q99542 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MMP19Q99542 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MMP19Q99542 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MMP19Q99542 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MMP19Q99542 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MMP19Q99542 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MMP19Q99542 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MMP19Q99542 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MMP19Q99542 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MMP19Q99542 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MMP19Q99542 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MMP19Q99542 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MMP19Q99542 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MMP19Q99542 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MMP19Q99542 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MMP19Q99542 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MMP19Q99542 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MMP19Q99542 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MMP19Q99542 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MMP19Q99542 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MMP19Q99542 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MMP19Q99542 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MMP19Q99542 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MMP19Q99542 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MMP19Q99542 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
MMP19Q99542 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MMP19Q99542 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
MMP19Q99542 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
MMP19Q99542 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
MMP19Q99542 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MMP19Q99542 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MMP19Q99542 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MMP19Q99542 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MMP19Q99542 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MMP19Q99542 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MMP19Q99542 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
MMP19Q99542 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms