Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC102AQ96A19 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102AQ96A19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102AQ96A19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms