Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX4Q969G2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms