Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTF1AQ7RTS3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms