Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPTNQ6XPR3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms