Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3EQ6PEY2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms