Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
JMJD6Q6NYC1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD6Q6NYC1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
JMJD6Q6NYC1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms